复旦大学附属肿瘤医院是国家卫生健康委员会预算管理单位，是复旦大学的直属附属医院，建院于1931年3月1日，是我国成立最早的，集医、教、研、防为一体的三级甲等肿瘤专科医院。
医院设有徐汇院区、浦东院区两个院区，并与上海市质子重离子医院（复旦大学附属肿瘤医院质子重离子中心）高度融合、共同发展。截至2020年底，医院实际开放床位2105张，设有头颈外科、乳腺外科、胸外科、胃外科、大肠外科、泌尿外科、胰腺外科、肝脏外科、神经外科、骨软组织外科、肿瘤妇科、肿瘤内科、放射治疗中心、中西医结合科、综合治疗科、麻醉科、介入治疗科、病理科、药剂科、检验科、内镜科、超声诊断科、放射诊断科、核医学科、心肺功能科、营养科26个临床医技科室。医院有教职员工2,761人，其中医师719人，护理人员1,242人，医技人员501人；正副高级专家373人；博士生导师78人，硕士生导师96人。
2020年医院门诊量144.81万人次，住院10.14万人次，手术5.78万人次，出院者平均住院日6.02天。医院在最新的“中国最佳医院综合排行榜”中位列第26位，居全国专科医院之首，病理科连续第10年蝉联全国第一；肿瘤学位列全国第二。在国家三级公立医院绩效考核中，考核成绩为A，位列肿瘤专科医院第二名。在2020年度申康中心绩效数据中保持全市领先，15个病种排名前五，其中甲状腺癌、乳腺癌、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、食道癌、胃癌、结直肠癌8大病种名列第一。2020年医院顺利通过三级甲等专科医院复评审，以评促建，实现医疗服务在量和质上的不断提升。
医院深入贯彻落实市委、市政府两院高度融合精神，与上海市质子重离子医院（复旦大学附属肿瘤医院质子重离子中心）高度融合、资源共享，将手术、化疗、光子放疗及质子重离子治疗技术融合进行肿瘤治疗，共同打造国际先进的肿瘤医学中心。上海市质子重离子医院（复旦大学附属肿瘤医院质子重离子中心）自2015年5月8日开业以来，在确保临床质量和安全的前提下，充分发挥质子重离子放疗对肿瘤的“定向爆破”优势，依托重离子技术优势，围绕鼻咽癌、颅内颅底肿瘤、早期肺癌、肝癌、前列腺癌等5个重点病种开展临床治疗，并对胰腺癌开展重点临床研究（“5+1”重点病种）。医院目前已收治患者超3200余例，其中2020年出院患者789例，与国际同类机构相较处于领先地位。医院将继续充分发挥尖端医疗设备、个性化医疗服务、国际水准的肿瘤粒子治疗专家团队等优势，不断提升这一医疗品牌在国内乃至世界的影响力和辐射力。
2021年，医院将以“十四五”规划为指引，加快推进国家癌症医学中心建设，打造临床研究高地，扩大优质资源辐射力量，为上海建设亚洲医学中心城市和具有全球影响力的科技创新中心助力护航。